Dejavniki, ki vplivajo na učinek flokulacije, so različni, predvsem tipa, koncentracija, odmerjanje flokulacijskega sredstva, stanje mešanja med koagulacijsko obdelavo, vrednost pH, temperaturo in njegove spremembe itd. V skladu s posebnimi pogoji je treba sprejeti različne protiukrepe.
1. Vrste in odmerki flokulantov: za različne odpadne vode je treba uporabiti različne flokulante. Količina flokulanta v veliki meri vpliva na učinek flokulacije. Prekomerna in nezadostna bo privedla do disperzije in stabilnosti delcev sol. Zato je treba optimalno odmerjanje določiti s poskusi.
2. Vpliv mešanja in reakcijskega časa: Po dodajanju določene flokulante v odpadno vodo je treba flokulant hitro in enakomerno razpršiti v vodo. Ko se flokulant popolnoma raztopi, bo koloid, ki nastane v stiku z originalnim koloidom in suspendirano snov v vodi, tvoril veliko drobnih svilenih cvetov, ki se imenuje tudi mešanje. Postopek mešanja zahteva intenzivno turbulenco v vodnem toku, kar omogoča, da se sredstvo temeljito meša z vodo v razmeroma hitrem času, kar običajno traja nekaj sekund do dve minuti.
3. Vpliv pH vrednosti in alkalnosti: pH vrednost močno vpliva na delovanje flokulanta. Kadar je odpadna voda flokulirana, je treba zadostno pozornost posvetiti efektivnemu območju pH. Omejitev pH vrednosti organskega polimernega flokulanta ni stroga, vendar nizka pH vrednost močno vpliva na učinek flokulacije flokulanta. Anorganski flokulant je občutljiv na pH vrednost odpadne vode. Ker reakcija hidrolize flokulanta neprekinjeno ustvarja vodikove ione, je treba dovolj ohraniti reakcijo hidrolize.
4. Vpliv temperature: Temperatura vode vpliva tudi na učinek flokulacije. Reakcija hidrolize anorganskega flokulanta je endotermična reakcija. Kadar je temperatura vode nizka, ne pripomore k hidrolizi flokulanta. Viskoznost vode je povezana tudi s temperaturo vode. Če je temperatura vode nizka, je viskoznost vode velika. Brownovo gibanje molekul vode je oslabljeno, kar ne pripomore k destabilizaciji in flokulaciji koloidnih onesnaževal v vodi, zato tvorba flokov ni lahko. Zato je količina flokulanta, ki se uporablja pozimi, večja kot poleti. Povišanje temperature je pripomoglo k trku med koloidi, vendar temperatura presega 90 stopinj Celzija, zaradi česar se staranje flokulanta ali razgradi, da nastane netopne snovi, vendar zmanjša učinek flokulacije.